Инструментальное средство поиска регуляторных мотивов в геномах
Транскрипционные факторы. Представление регуляторных элементов. Алгоритмы поиска мотивов. Скрытые Марковские модели и вспомогательные алгоритмы. Тестирование на сгенерированных и реальных данных, отличия в показателях. Сравнение с другими алгоритмами.
Подобные документы
Теоретические сведения. Основные понятия. Строка, её длина, подстрока. Понятие о сложности алгоритма. Алгоритмы основанные на методе последовательного поиска. Алгоритмы Рабина, Кнута - Морриса - Пратта, Бойера – Мура.
курсовая работа, добавлен 13.06.2007Способы построения остовного дерева (алгоритма поиска в глубину и поиска в ширину). Вид неориентированного графа. Понятие и алгоритмы нахождения минимальных остовных деревьев. Последовательность построения дерева графов по алгоритмам Крускала и Прима.
презентация, добавлен 16.09.2013Методы реализации алгоритмов сортировки и алгоритмов поиска на языках программирования высокого уровня. Программирование алгоритмов сортировки и поиска в рамках создаваемого программного средства на языке Delphi. Создание руководства пользователя.
курсовая работа, добавлен 16.04.2012Создание компьютерных программ. Сравнение C# с другими языками программирования. Решение задач транспортной логистики. Теория графов и структуры данных. Алгоритмы поиска маршрутов в графе. Выбор среды разработки. Редактирование транспортной сети.
курсовая работа, добавлен 08.10.2015Классы задач P и NP, их сводимость. Примеры NP-полных и NP-трудных задач. Сущность метода поиска с возвратом. Алгоритмы решения классических задач комбинаторного поиска. Решение задачи о восьми ферзях. Поиск оптимального решения методом ветвей и границ.
презентация, добавлен 19.10.2014Описание алгоритма сортировки с двоичным включением, выбор структур данных. Пример сортировки массива, отсортированного случайным образом. Алгоритм покрытия по методу "Построение одного кратчайшего покрытия". Волновой алгоритм поиска длиннейшего пути.
курсовая работа, добавлен 24.09.2010Организация возможности просмотра текстовых файлов и осуществления поиска нужных слов в тексте. Редактирование текста (шрифт, размер). Алгоритм поиска подстроки в строке (метод Кнута-Морриса-Пратта). Загрузка текста из файла (с расширением .txt).
курсовая работа, добавлен 29.05.2013Проект экспериментального программного комплекса индексирования и поиска неструктурированной текстовой информации в многоязычной среде, состоящего из математических моделей, алгоритмов и программных средств. Исследование характеристик его эффективности.
автореферат, добавлен 31.01.2012Теоретические сведения об алгоритмах поиска подстроки в строке. Глобализация информации в сети Internet. Интеллектуальный поиск. Алгоритм последовательного (прямого) поиска, Рабина и их применение. Анализ алгоритмов. Реализация программного кода.
курсовая работа, добавлен 12.02.2009Алгоритмы и алфавит языка Турбо Паскаль. Основные типы данных. Операторы присваивания, перехода и выбора. Понятие массива в Паскале. Особенности работы со строками в программе. Использование линейного поиска и поиска с барьером. Основные виды сортировок.
учебное пособие, добавлен 09.11.2009Разработка программной базы для исследований в области распознавания речи и поиска ключевых слов в ней. Расчет mel-фильтров. Скрытые марковские модели. Применение в алгоритме сверточного декодирования Витерби. Методы визуализации и обработки аудиоданных.
курсовая работа, добавлен 01.06.2015Задача нахождения кратчайшего покрытия булевой матрицы. Алгоритмы поиска кратчайших покрытий методом Патрика и методом Закревского. Метод предварительного редуцирования булевой матрицы. Описание программы "Нахождение кратчайшего покрытия булевых матриц".
курсовая работа, добавлен 12.12.2010Работа с массивами, их ввод и вывод, организация программ циклической структуры. Способы описания и использования массивов, алгоритмы их сортировки, сортировка выбором и вставками. Алгоритмы поиска элемента в неупорядоченном и упорядоченном массивах.
лабораторная работа, добавлен 03.10.2010Задача об оптимальном графе для децентрализованного поиска. Жадный алгоритм. Модель Клайнберга. Математическая модель. Алгоритмы решения. Алгоритм локального поиска. Табу алгоритм. Метод ветвей и границ. Выбор между одинаковыми соседями. Стартовый граф.
дипломная работа, добавлен 23.10.2016Особенности и преимущества языка C#. Алгоритмы поиска маршрутов в графе. Разработка вычислительной системы транспортной логистики на языке C#. Выбор среды разработки, визуализация транспортной сети. Задание условий поиска и пример работы алгоритма.
дипломная работа, добавлен 24.06.2015Создание программы для поиска минимума функции двух вещественных переменных в заданной области с помощью генетического алгоритма. Генетические алгоритмы и операторы. Создание начальной популяции. Размножение. Мутация и селекция. Тестирование программы.
курсовая работа, добавлен 22.02.2015Разработка программной реализации решения задачи о минимальном покрывающем дереве графа (построение минимального остова), используя алгоритмы Прима и Крускала. Подсчет времени работы алгоритмов. Их программная реализация на практике с помощью Delphi 7.
курсовая работа, добавлен 29.08.2010Рассмотрение и анализ моделей и алгоритмов семантического поиска в мультиагентной системе поддержки пользователей. Ознакомление с интерфейсом чата с ботом. Изучение и характеристика экспериментальных оценок релевантности и пертинентности запросов.
дипломная работа, добавлен 13.10.2017Алгоритмы, алфавит языка, структура программы, написанной на Турбо Паскале. Целые, вещественные, логические, символьные типы данных, их совместимость. Линейные алгоритмы, пустой и составной операторы, простейший ввод и вывод, разветвляющиеся алгоритмы.
курсовая работа, добавлен 03.11.2009Задачи компьютерного зрения. Анализ, разработка и реализация алгоритмов поиска и определения движения объекта, его свойств и характеристик. Алгоритмы поиска и обработки найденных областей движения. Метод коррекции. Нахождение объекта по цветовому диапазон
статья, добавлен 29.09.2008Алгоритмы поиска динамических шумов и их компенсации на основе метода Motion estimation. Разработка программного продукта для детектирования движения капель дождя и их удаления на видеопоследовательностях, и его реализация среде Microsoft Visual Studio.
магистерская работа, добавлен 09.02.2013Способ представления графа в информатике. Алгоритмы поиска элементарных циклов в глубину в неориентированных графах. Описание среды wxDev-C++, последовательность создания проекта. Руководство пользователю программы поиска и вывода на экран простых циклов.
курсовая работа, добавлен 18.02.2013Исследование основных концепций информационного поиска: булева и векторная модели, меры подобия и определение веса индексных терминов. Оценка неранжированных наборов результата поиска. Реализация векторной модели в среде Matlab, листинг программы.
реферат, добавлен 15.07.2012Обработка текстовых данных, хранящихся в файле. Задачи и алгоритмы обработки больших массивов действительных и натуральных чисел. Практические задачи по алгоритмам обработки данных. Решение задачи о пяти ферзях. Программа, которая реализует сортировку Шел
курсовая работа, добавлен 09.02.2011Исследование проблемы сравнения звуковых файлов и определение степени их схожести. Сравнение файлов с использованием метода нечеткого поиска, основанного на метрике (расстоянии) Левенштейна. Сравнение MIDI-файлов и реализация алгоритмов считывания.
курсовая работа, добавлен 14.07.2012