Метод сборки контигов геномных последовательностей из парных чтений с ошибками вставки и удаления на основе совместного применения графов де Брёйна и графов перекрытий
Сборка генома как одна из задач современной биологии и медицины. Алгоритм, использующий небольшой объем оперативной памяти и позволяющий использовать чтения с ошибками вставки и удаления. Сборка контигов из квазиконтигов с использованием графа перекрытий.
Подобные документы
Актуальность разработки библиотек для работы с графами. Алгоритмы решения задач оптимизации на графах. Создание пользовательской функции для вычисления двумерной экспоненциальной функции. Программа изображения структуры неориентированного графа.
учебное пособие, добавлен 20.11.2010Основные определения и понятия теории графов. Оптимизация решения задач с применением эволюционно-генетического подхода. Повышение технологичности и простоты конструктивного оформления элементов принципиальных схем на основе генетических алгоритмов.
курсовая работа, добавлен 28.02.2018Анализ алгоритма рекуррентной формулы для вычисления определителей предфрактальных графов с полными затравками, сохраняющими смежность старых ребер в траектории. Определитель матрицы смежностей графа. Задача вычисления определителей матриц смежности.
статья, добавлен 29.04.2017История возникновения теории графов, основные понятия и теоремы. Способы представления графов в компьютере, исходя из потребностей конкретной задачи. Использование средств визуальной разработки, применение программы определения кратчайшего пути в графах.
курсовая работа, добавлен 14.12.2010Способы распределения вычислительной нагрузки. Представление задачи в виде графа. Алгоритмы разбиения графа. Алгоритмы размещения графа на ЭВМ. Графическое представление графов. Принцип передачи данных. Синхронизация процессов и моделирование объектов.
автореферат, добавлен 18.03.2016Общая характеристика различных языков программирования. Реализация QBE в Access: добавление и удаление таблиц в запросе, перекрестные и корректирующие запросы. Операции вставки удаления и модификации языка QBE. Характеристика языков QBE современных СУБД.
курсовая работа, добавлен 15.07.2012Разработка основной методики построения эффективных процедур вставки информации в структурно-независимые базы данных, использующая деятельностный подход. Особенность применения однородной по структуре структурно-независимого информационного хранилища.
статья, добавлен 12.01.2018Определение минимальных путей - одна из практических задач, в решении которой применяется теория графов и программные инструменты для ее практической реализации. Методика определения коэффициента распознаваемости алгоритма идентификации объектов.
статья, добавлен 17.12.2020Разработка методов обнаружения и предотвращения блокировки процессов обмена информацией на основе размеченных потоковых графов, позволяющих оценивать устойчивость и разметку сети, а также анализировать разные невыявленные процессы обмена информацией.
статья, добавлен 25.08.2020- 35. Теория графов
История и основные термины теории графов. Представление их в электронно-вычислительной машине. Задача коммивояжера. Метод ветвей и границ. Решение задачи аналитическим методом. Постановка задачи, создание приложения для ее решения. Тестирование программы.
курсовая работа, добавлен 04.09.2013 - 36. Графовые сети
Основные понятия и виды графов. История теории графов: модель Эйлера; метафора Холтона. Общие свойства формальных теорий. Идеи, принципы, аналитическая компонента, язык теории графов. Абстрактные и семантические графовые сети. Топология компьютерной сети.
реферат, добавлен 06.03.2015 Расположение деталей в системном блоке персонального компьютера. Понимание внутренних частей корпуса. Подготовка материнской платы. Особенности монтажа материнской платы на стойку. Алгоритм установки операционной системы как этап сборки компьютера.
реферат, добавлен 02.02.2015- 38. Виды памяти
Объем и исполнение оперативной памяти для временного хранения данных и программ. Базовая система ввода-вывода. Сохранение настроек, необходимых для работы программ BIOS на CMOS-памяти. Назначение Кэш-памяти процессора. Устройство современной видеокарты.
реферат, добавлен 08.04.2014 Основные термины и теоремы теории графов. Задачи на графах. Разработка интерфейса программного комплекса. Определение классов и модулей программы. Программная реализация редактора изучения теории графов. Выбор программной платформы и среды разработки.
дипломная работа, добавлен 28.05.2019Изучение основных технических характеристик оперативной памяти компьютера, используемой для современных вычислительных устройств. Особенности функционирования ОЗУ на основе графеновых нанолент или нанотрубок. Классификация видов оперативной памяти.
курсовая работа, добавлен 17.02.2014Выбор соответствующей структуры данных для представления графа. Идея метода получения правильной раскраски. Поиск минимальной раскраски вершин графа. Использование задачи о наименьшем покрытии при раскраске вершин графа. Потоки в сетях, паросочетания.
курсовая работа, добавлен 11.03.2010Понятие оперативной памяти (ОЗУ) в информатике, ее сущность и предназначение. Основное преимущество динамической оперативной памяти (DRAM). Особенности статической оперативной памяти (SRAM). Взаимодействие оперативной памяти с центральным процессором.
презентация, добавлен 14.12.2015Основные типы оперативной памяти и их технические характеристики. Статическая память SRAM. Основные фирмы–производители оперативной памяти. Цель и назначение ремонта модулей оперативной памяти. Программы для тестирования и дефрагментации памяти.
курсовая работа, добавлен 11.06.2013Понятия теории графов. Представление задачи в виде теоремы. Поиск решений в пространстве состояний и при сведении задач к подзадачам. Процедура построения графа состояний на примере выбора маршрута транспортным роботом. Свойства эвристических алгоритмов.
реферат, добавлен 30.10.2013Разработка алгоритма шифрования файла с использованием схемы разворачивания ключа из PIN-кода (пароля) небольшой длины на основе генератора со сжатием для больших степеней полинома. Разработка программы-приложения, которая реализует заданный алгоритм.
курсовая работа, добавлен 16.06.2016Алгоритмы разбиения графов на подграфы и их необходимость при решении многих прикладных задач, при автоматизации проектирования и контроля, при автоматическом анализе содержания документов. Поиск в глубину и в ширину; метод динамического программирования.
статья, добавлен 19.01.2018Пирамидальная сортировка как метод, быстродействие которого оценивается как О (n log n). Процесс построения пирамиды. Плавный метод сортировки, операция просеивания. Уменьшение последовательности куч путем удаления элемента. Макет и алгоритм приложения.
курсовая работа, добавлен 22.09.2017Рассмотрение основных областей применения теории графов, созданной Эйлером. Характеристика принципов разработки программы "Построение Эйлерова цикла" на языке Си с использованием графического отображения для визуализации и улучшения интерфейса программы.
курсовая работа, добавлен 22.02.2019Пошаговая процедура построения графов. Оценка сложности алгоритма построения графов первой версии и составления таблиц факторизаций. Методы факторизации натуральных чисел. Сложности комбинаторных методов решения целочисленных математических проблем.
статья, добавлен 19.01.2018Рассмотрение способа воспроизведения и интерактивного редактирования ориентированных и неориентированных графов. Достижение визуального изменения координат вершин на рисунке графа с применением стека изменений практически неограниченной глубины.
статья, добавлен 30.04.2018