Метод сборки контигов геномных последовательностей из парных чтений с ошибками вставки и удаления на основе совместного применения графов де Брёйна и графов перекрытий

Сборка генома как одна из задач современной биологии и медицины. Алгоритм, использующий небольшой объем оперативной памяти и позволяющий использовать чтения с ошибками вставки и удаления. Сборка контигов из квазиконтигов с использованием графа перекрытий.

Подобные документы

  • Искусственная нейронная сеть как метод анализа и распознавания образов. Обработка изображения и создание множества обучающих примеров с ошибками. Обучение нейронных сетей с использованием математического пакета Octave. Отбор и тест оптимальной сети.

    лабораторная работа, добавлен 14.12.2019

  • Характеристика задачи распределения памяти специализированной ЭВМ в условиях ограниченных ресурсов. Алгоритм, позволяющий обеспечить максимальную независимость проверяемых частей, простоту контроля программы распределения памяти специализированной ЭВМ.

    статья, добавлен 27.02.2019

  • Запуск нескольких программ без абстракций памяти. Понятие адресного пространства. Программистская модель оперативной памяти и способы эффективного управления ее использованием. Базовый и ограничительный регистры. Работа системы с использованием свопинга.

    лекция, добавлен 21.10.2013

  • Математическое моделирование дискретно-событийных динамических систем как одно из направлений науки теории управления. Анализ отличительных особенностей графического интерфейса реализованного программного редактора временных графов синхронизации.

    курсовая работа, добавлен 29.06.2016

  • Изучение основных элементов многофункциональных устройств и их технических характеристик. История и основные сведения о сервере. Сборка сервера, выбор эффективной системы охлаждения. Неисправности блока питания, жёстких дисков, процессора; их устранения.

    дипломная работа, добавлен 25.07.2015

  • Анализ объекта прохождения практики, требований и условий труда. Исследование выполняемых работ и используемых инструментов. Рассмотрение компонентов, технологического процесса сборки системного блока и подключения к сети. Проведение диагностики ПК.

    отчет по практике, добавлен 30.04.2014

  • Граф-схема алгоритма раскраски заданным числом цветов на основе известного алгоритма последовательного сокращенного перебора вершин. Программирование граф-схемы на языке Object Pascal, сохранение графов в файлах специального упакованного формата.

    курсовая работа, добавлен 31.10.2017

  • Построение графика и таблицы значений функции согласно заданию на основе программы MS Excel. Статистический анализ с использованием функций. Построение гистограммы распределения данных. Создание запроса для удаления записей на основе СУБД Access.

    контрольная работа, добавлен 17.12.2015

  • Возможности оптимизации использования оперативной памяти компьютера. Распределение расширенной памяти в MS-DOS начиная с версии 5.0. Использование дополнительной памяти на плате, вставленной в слот расширения материнской платы компьютера; вызов драйвера.

    презентация, добавлен 30.05.2022

  • Подходы к изучению причин труднорешаемости задач комбинаторской оптимизации. Способ исследования свойств графов многогранников задач. Изучение комбинаторско-геометрических характеристик сложности для задач с различными ограничениями. Теория сводимости.

    автореферат, добавлен 08.02.2013

  • Платформа ПК. Покупать или продавать. Азука будущего компьютеровладельца. Готовые компьютеры. Сборка компьютеров на заказ. Компьютеры "с рук". Сколько стоит компьютер. Типовые конфигурации. Архитектура компьютера. Развитие компьютерной индустрии.

    дипломная работа, добавлен 17.09.2008

  • Моделирование в многоэлементных системах. Исследование операций методом динамики средних. Определение средних количеств элементов (математических ожиданий), находящихся в одинаковых состояниях. Моделирование сборки и отжига деталей в GPSS World.

    контрольная работа, добавлен 16.04.2020

  • Изучение типов визуализации данных программных продуктов Hewlett-Packard. Анализ подобия между объектов сравнения с применением подхода основанного на сингулярном разложении матриц смежности графов. Суть информации, касающейся сценариев использования.

    статья, добавлен 27.02.2018

  • Понятие "динамической" памяти (DRAM). Память с произвольным доступом (RAM). Микросхемы SDRAM: физическая организация, принцип работы. Схема обращения к ячейке памяти. Параметры логической организации микросхем памяти. Модули памяти: микросхема SPD.

    реферат, добавлен 24.06.2012

  • Рассмотрены существующие распределенные алгоритмы выравнивания последовательностей ДНК для модели MapReduce. Представлен трехэтапный алгоритм выравнивания последовательностей ДНК, при построении которого были учтены проблемы уже имеющихся алгоритмов.

    статья, добавлен 15.01.2019

  • Организация оперативной памяти и унифицированной системы документации. Оценка быстродействия микропроцессорного устройства. Организация на микросхемах оперативной памяти заданной емкости. Разработка микропроцессорного устройства, его структурная схема.

    контрольная работа, добавлен 24.03.2016

  • Особенности формирования списка окрестностей вершин ориентированного графа по заданной матрице инцидентности. Рассмотрение основных способов представления графов, анализ матрицы смежности. Знакомство со средой разработки Microsoft Visual Studio 2005.

    контрольная работа, добавлен 13.12.2015

  • Комбинаторика, нахождение минимальных путей между вершинами графов. Понятие информационных математических моделей, сущность алгоритма. Нахождение и сортировка минимумов и максимумов в массиве. Компенсация и вычисление ранга матрицы; метод ветвей и границ.

    учебное пособие, добавлен 24.10.2013

  • Изучение функционирования и взаимодействия операционной системы с оперативной памятью. Анализ основных типов, параметров оперативной памяти применяемых в системных платах персонального компьютера. Потребности отдельных программ в ресурсе памяти.

    реферат, добавлен 17.03.2015

  • Метод конечных элементов является численным методом для дифференциальных уравнений, встречающихся в физике. Механизм и закономерности компактного хранения матрицы жесткости. Анализ и оценка экономии процессорного времени и затрат оперативной памяти.

    учебное пособие, добавлен 18.06.2015

  • Анализ методов решения задачи, разработка алгоритма решения задачи. Реализация, тестирование программного средства. Проектирование и описание пользовательского интерфейса. Блок-схема алгоритма программы, рекурсивный алгоритм удаления элементов из очереди.

    курсовая работа, добавлен 21.04.2022

  • Понятие и свойства внутренней памяти компьютера. Принципиальная схема оперативной памяти. Устройства внешней памяти: гибкие и жесткие магнитные диски, лазерные дисководы и диски, устройства на основе flash-памяти, их сравнительная характеристика.

    презентация, добавлен 07.05.2015

  • Основные определения понятий алгоритма и архитектуры. Понятия и типы элементов теории графов. Многоуровневая организация архитектуры вычислительной системы. Структурная схема операционной системы. Система управления современной вычислительной машины.

    курс лекций, добавлен 19.11.2013

  • Исследование применения статистической оценки энтропии Тсаллиса в качестве тестовой статистики для анализа близости выходных последовательностей криптографических генераторов псевдослучайных последовательностей. Метод статистического тестирования.

    доклад, добавлен 03.05.2019

  • Рассмотрение основных комплектующих персонального компьютера: корпуса, блока питания, материнской платы, процессора, системы охлаждения, оперативной памяти, накопителей информации, устройств записи. Ознакомление с главными этапами сборки компьютера.

    контрольная работа, добавлен 27.03.2022

Работы в архивах красиво оформлены согласно требованиям ВУЗов и содержат рисунки, диаграммы, формулы и т.д.
PPT, PPTX и PDF-файлы представлены только в архивах.
Рекомендуем скачать работу и оценить ее, кликнув по соответствующей звездочке.