Метод сборки контигов геномных последовательностей из парных чтений с ошибками вставки и удаления на основе совместного применения графов де Брёйна и графов перекрытий

Сборка генома как одна из задач современной биологии и медицины. Алгоритм, использующий небольшой объем оперативной памяти и позволяющий использовать чтения с ошибками вставки и удаления. Сборка контигов из квазиконтигов с использованием графа перекрытий.

Подобные документы

  • Архитектура фон Неймана, как метод совместного хранения программ и данных в памяти компьютера. Особенность устройства центрального процессора. Принципы разработки современных маршрутизаторов. Характеристика сборки модулей сохранения информации и их типы.

    курсовая работа, добавлен 22.12.2014

  • Сборка персонального компьютера для работы с текстом и графикой среднего качества; печати изображений; сканирования печатных изображений и пленок; работа в сети интернет с вхождением в состав локальной сети с поддержкой сетевой технологии Ethernet.

    контрольная работа, добавлен 07.05.2012

  • Понятие, сущность и значение оперативного запоминающего устройства, основные характеристики оперативной памяти. Описание и специфика модуля памяти. Взаимосвязь и отличительные черты винчестера и оперативной памяти, их использование в работе компьютера.

    презентация, добавлен 09.12.2015

  • Доказывание достаточного признака отсутствия гамильтоновой цепи в графе. Пример удаления одной вершины из цепи. Удаление вершин из гамильтонова графа. Метод нахождения гамильтонова пути, основанный на алгоритме нахождения гамильтонова цикла в графе.

    статья, добавлен 09.04.2016

  • Разработка приложения для визуализации структуры данных очереди с возможностью добавления и удаления элементов. Алгоритм реализации очереди. Описание JavaFX Scene Builder. Алгоритм реализации открытия и сохранения файлов. Анализ методов отладки системы.

    курсовая работа, добавлен 20.09.2016

  • Реализация алгоритмов обработки графовых структур. Поиск кратчайших путей между вершинами, проверка связности. Алгоритм Флойда-Уолша. Выбор необходимого алгоритма и структуры для представления графов. Построение остовых деревьев минимальной стоимости.

    лабораторная работа, добавлен 26.03.2019

  • Проблема низкого уровня большинства сайтов в Интернете, которые разрабатываются с совершением ограниченного количества типичных ошибок, с использованием шаблонов сайтов и ошибками в них. Структура западного веб-сайта и целевая аудитория проекта devbase.ru

    статья, добавлен 29.09.2012

  • Выравнивание последовательностей ДНК как важная и сложная задача биоинформатики. Исследование алгоритма выравнивания последовательностей ДНК для популярной модели распределенных вычислений MapReduce. Анализ уже существующих решений для данной модели.

    статья, добавлен 15.01.2019

  • Преобразование алгоритмов, основанных на использовании суффиксных деревьев. Построение графов связей между ключевыми словосочетаниями согласно анализируемому корпусу текстов. Разработка модифицированного программного продукта, реализующего алгоритмы.

    дипломная работа, добавлен 07.07.2016

  • Иерархия запоминающих устройств. Неотъемлемые свойства кэш-памяти. Кэширование как универсальный метод, пригодный для ускорения доступа к оперативной памяти. Принцип действия и схема функционирования кэш-памяти. Решение проблемы согласования данных.

    реферат, добавлен 21.03.2011

  • Главная страница и страницы создания новой записи, чтения данных по индексу, обновления и удаления существующей записи. Характеристика особенностей формирования данных CRUD с помощью PHP. Примеры кода для понимания и применения в реальных проектах.

    практическая работа, добавлен 21.03.2024

  • Анализ программных систем, позволяющих создавать и использовать локальные и удаленные базы данных. Основные функции СУБД: управление данными во внешней памяти, буферами оперативной памяти, транзакциями, протоколирование. Способы передачи данных в сети.

    реферат, добавлен 03.04.2013

  • Теория графов как область дискретной математики, особенностью которой является геометрический подход к изучению объектов. Обзор элементов языка программирования. Общая постановка задачи. Таблица идентификаторов комплекса. Набор необходимых данных.

    курсовая работа, добавлен 24.01.2014

  • Разработка алгоритма численного решения задач полубесконечной оптимизации с использованием экстраполирования минимизируемого поля на каждой итерации и оценка эффективности его применения. Использование псевдокубических сплайнов в качестве экстраполята.

    статья, добавлен 31.08.2018

  • Изучение алгоритма распознавания единичного интервального графа с помощью трех проходов алгоритма лексикографического поиска. Обзор алгоритма 4-махов для распознавания интервальных графов. Особенности реализации алгоритмов в виде компьютерной программы.

    дипломная работа, добавлен 04.08.2016

  • Обработка графов, задача поиска всех кратчайших путей. Последовательный алгоритм Флойда. Пример нахождения минимального охватывающего дерева. Пример разделения нерегулярной сети и соответствующей сети граф. Сущность метода рекурсивного деления пополам.

    учебное пособие, добавлен 17.09.2013

  • Подключение мышки, клавиатуры, монитора, USB-устройств к компьютеру. Пошаговая сборка системного блока. Подключение электрического провода к блоку питания. Включение переключателя на сетевом фильтре. Подключение остальных внешних устройств к компьютеру.

    доклад, добавлен 29.02.2012

  • Изучение функции "поиска подобных документов" как способа повышения качества информационного поиска в полнотекстовых базах. Алгоритм определения степени семантического сходства текста с эталоном. Схема оценки текстов на семантическое сходство с эталоном.

    статья, добавлен 25.08.2020

  • Способы борьбы с ошибками, возникающими при передаче информации. Представление двоичных кодов с помощью куба. Функции корректирующих и линейных групповых кодов. Методы реализации кода Хэмминга. Алгоритм построения кода для исправления одиночной ошибки.

    реферат, добавлен 06.09.2013

  • Описание реализованного автомата разбора. Анализ особенностей использования Graphviz – программного обеспечения визуализации графа, позволяющего представлять различную информацию как диаграммы абстрактных графов и сетей. Программная реализация автомата.

    курсовая работа, добавлен 19.01.2020

  • Описание процесса разработки адаптируемой системы контроля знаний студентов в предметной области "Теория графов". Рассмотрение различных способов проектирования и разработки адаптируемых обучающих систем, существующих систем оценки и контроля знаний.

    дипломная работа, добавлен 02.09.2018

  • Рассмотрение памяти как одного из блоков ЭВМ, состоящего из запоминающих устройств и предназначенного для запоминания, хранения и выдачи информации (алгоритма обработки данных и самих данных). Основные характеристики отдельных ЗУ и требования к ним.

    статья, добавлен 25.02.2019

  • Возможность вставки картинки, рисунка и отсканированной фотографии из других программ в программной среде Microsoft Excel. Математические формулы и функции. Относительная и абсолютная адресация ячеек. Форматирование и редактирование электронных таблиц.

    презентация, добавлен 07.04.2018

  • Анализ алгоритмов сортировки методом бинарных и двухпутевых вставок, а также особенности построения инструментальных средств его реализации в виде алгоритмического и программного обеспечения. Методика разработки программы быстрой сортировки массива.

    курсовая работа, добавлен 22.01.2010

  • Цель и назначение ремонта модулей оперативной памяти, правила их технической эксплуатации. Методы устранения неполадок, программы для тестирования и дефрагментации памяти. Расчет затрат на замену модулей оперативной памяти и стоимости тестирования.

    курсовая работа, добавлен 07.07.2012

Работы в архивах красиво оформлены согласно требованиям ВУЗов и содержат рисунки, диаграммы, формулы и т.д.
PPT, PPTX и PDF-файлы представлены только в архивах.
Рекомендуем скачать работу и оценить ее, кликнув по соответствующей звездочке.